Centros y Secciones de Estudios de Posgrado
- Centro de Biotecnología Genómica (CBG)
- Centro de Desarrollo de Productos Bióticos (CEPROBI)
- Centro de Innovación y Desarrollo Tecnológico en Cómputo (CIDETEC)
- Centro de Investigación e Innovación Tecnológica (CIITEC) Unidad Azcapotzalco
- Centro de Investigación en Biotecnología Aplicada (CIBA) Unidad Tlaxcala
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA) Unidad Altamira
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA) Unidad Legaria
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA) Unidad Querétaro
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA) Unidad Morelos
- Centro de Investigación y Desarrollo de Tecnología Digital (CITEDI) Unidad Tijuana
- Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas (CICIMAR)
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR) Unidad Durango
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR) Unidad Michoacán
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR) Unidad Oaxaca
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR) Unidad Sinaloa
- Centro Interdisciplinario de Investigación y Estudios sobre Medio Ambiente y Desarrollo (CIIEMAD)
- Centro Mexicano para la Producción más Limpia (CMP+L)
- Centro de Investigación en Computación (CIC)
- Centro de Investigaciones Económicas Administrativas y Sociales (CIECAS)
- SEPI - Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB)
- SEPI - Escuela Superior de Comercio y Administración (ESCA) Unidad Santo Tomás
- SEPI - Escuela Superior de Cómputo (ESCOM)
- SEPI - Escuela Superior de Física y Matemáticas (ESFM)
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME) Unidad Azcapotzalco
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME) Unidad Ticomán
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería y Arquitectura (ESIA) Unidad Ticomán
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería y Arquitectura (ESIA) Unidad Tecamachalco
- SEPI - Escuela Superior de Medicina (ESM)
- SEPI - Unidad Profesional Interdisciplinaria en Ingeniería y Tecnologías Avanzadas (UPIITA)
- SEPI - Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería y Ciencias Sociales y Administrativas (UPIICSA)
- SEPI - Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Guanajuato (UPIIG)
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería Textil (ESIT)
- SEPI - Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía (ENMyH)
- SEPI - Escuela Superior de Comercio y Administración (ESCA) Unidad Tepepan
- SEPI - Escuela Superior de Economía (ESE)
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería Química e Industrias Extractiva (ESIQIE)
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME) Unidad Culhuacán
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME) Unidad Zacatenco
- SEPI - Escuela Superior de Ingeniería y Arquitectura (ESIA) Unidad Zacatenco
- SEPI - Escuela Superior de Turismo (EST)
- SEPI - Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnología (UPIBI)
- SEPI - Escuela Superior de Enfermería y Obstetricia (ESEO)
- SEPI - Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Hidalgo (UPIIH)
- SEPI - Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud (CICS) Unidad Santo Tomás
- SEPI - Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud (CICS) Unidad Milpa Alta